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However, the most crucial aspect of the process is that the reference gene must be stable. The selection of these reference genes was traditionally carried out in molecular biology using qualitative or semi-quantitative studies such as the visual examination of RNA gels, northern blot densitometry or semi-quantitative PCR PCR mimics.

Now, in the genome era, it is possible to carry out a more detailed estimate for many organisms using transcriptomic technologies.

A number of statistical algorithms have been developed that can detect which gene or genes are most suitable for use under given conditions.

Those like geNORM or BestKeeper can compare pairs or geometric means for a matrix of different reference genes and tissues.

Diagnostic qualitative PCR is applied to rapidly detect nucleic acids that are diagnostic of, for example, infectious diseases , cancer and genetic abnormalities.

The introduction of qualitative PCR assays to the clinical microbiology laboratory has significantly improved the diagnosis of infectious diseases , [30] and is deployed as a tool to detect newly emerging diseases, such as new strains of flu and coronavirus , in diagnostic tests.

Quantitative PCR is also used by microbiologists working in the fields of food safety, food spoilage and fermentation and for the microbial risk assessment of water quality drinking and recreational waters and in public health protection.

The agricultural industry is constantly striving to produce plant propagules or seedlings that are free of pathogens in order to prevent economic losses and safeguard health.

Systems have been developed that allow detection of small amounts of the DNA of Phytophthora ramorum , an oomycete that kills Oaks and other species, mixed in with the DNA of the host plant.

Discrimination between the DNA of the pathogen and the plant is based on the amplification of ITS sequences, spacers located in ribosomal RNA gene's coding area, which are characteristic for each taxon.

Alternatives such as DNA or protein analysis are usually less sensitive. Specific primers are used that amplify not the transgene but the promoter , terminator or even intermediate sequences used during the process of engineering the vector.

As the process of creating a transgenic plant normally leads to the insertion of more than one copy of the transgene its quantity is also commonly assessed.

This is often carried out by relative quantification using a control gene from the treated species that is only present as a single copy.

Viruses can be present in humans due to direct infection or co-infections which makes diagnosis difficult using classical techniques and can result in an incorrect prognosis and treatment.

The use of qPCR allows both the quantification and genotyping characterization of the strain, carried out using melting curves of a virus such as the Hepatitis B virus.

From Wikipedia, the free encyclopedia. Redirected from Quantitative PCR. For reverse transcription polymerase chain reaction RT-PCR , see reverse transcription polymerase chain reaction.

This article relies too much on references to primary sources. Please improve this by adding secondary or tertiary sources. July Learn how and when to remove this template message.

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Bustin; Vladimir Benes; Jeremy A. Pfaffl; Gregory L. Wittwer April Lucia, Alejandro ed. Bibcode : PLoSO J Mol Med. BMC Mol. Ravasi T ed.

Archived from the original on DOI: BackgroundGene-expression analysis is increasingly important in biological research, with real-time reverse transcription PCR RT-PCR becoming the method of choice for high-throughput and accurate expression profiling of selected genes.

View on Springer. Save to Library. Create Alert. Launch Research Feed. Share This Paper. Paper Mentions. The Molecular Biology Blog. Citations Publications citing this paper.

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Editorship — Böck, R. Lecture Notes in Artificial Intelligence; Vol. Journal of Electronic Imaging, 24 5 , Conference proceedings — Poppe, R.

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Posted by Fenririsar

5 comments

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